Diagnostic microbiologique des principales infections bactériennes et virales (Tableau 2 : Liste des analyses assurées par le laboratoire de Microbiologie).
Pour les malades hospitalisés :
Les prélèvements sont réalisés au sein du service hospitalier, en fonction du type de l’analyse demandée. Ils sont ensuite acheminés au laboratoire en respectant les conditions de transport adaptées pour chaque type de prélèvement (Guide de prélèvements).
Pour les malades externes : Les prélèvements se font de 7h30 à 10h30
- Sérologies bactériennes et virales : Les prélèvements se font à la salle de prélèvement au laboratoire de Biochimie, située à proximité du laboratoire de microbiologie. Ils seront ensuite acheminés, par le malade lui-même, au laboratoire de microbiologie où ils seront validés et traités.
- Examen cytobactériologique des urines (ECBU) : Les prélèvements urinaires se font au laboratoire de microbiologie sans rendez- vous préalable.
- Recherche de mycobactéries : Les patients se présentent au laboratoire pour récupérer les crachoirs stériles dans lesquels seront collectés les crachats 3 jours de suite. Les prélèvements peuvent être conservés à domicile, au réfrigérateur à +4°C et acheminés au laboratoire le 3ème jour.
- Prélèvements vaginaux : Ils se font au laboratoire sur rendez-vous ; à raison de 2 fois par semaine (tous les mardis et mercredis).
- Prélèvements urétraux : Ils sont assurés, au laboratoire sans rendez-vous préalable.
- Autres prélèvements (pus divers, prélèvements respiratoires…) : Ils sont réalisés dans les consultations externes et doivent être rapidement acheminés au laboratoire en respectant les conditions de prélèvement et de transport adaptées pour chaque type de prélèvement, en fonction du type de l’analyse demandée (Guide de prélèvements).
Modalités de prise des RDV pour les prélèvements vaginaux : C’est la surveillante du laboratoire qui valide la feuille de demande (qui doit être convenablement remplie) et donne les rendez-vous. Elle fournit par la même occasion un document précisant les précautions à prendre pour avoir un prélèvement de qualité.
Les analyses spécialisées (Recherche de M. tuberculosis avec recherche de la résistance à la rifampicine par GenExpert, Détection des virus de la grippe par RT-PCR) : une demande préalable avec présentation du cas au biologiste responsable qui valide la demande.
Pour la détection des virus de la grippe et du SARS-CoV2 par RT-PCR, les prélèvements doivent être faits par un personnel formé et qualifié, sur milieu de transport virologique adapté. L’acheminement doit se faire à +4°C, le plus rapidement possible. La fiche de demande d’analyse correspondante doit être convenablement remplie (Fiche de demande de détection des virus grippaux, Fiche de demande de détection du SARS-CoV2).
Notre laboratoire est un Laboratoire National de Référence dans plusieurs domaines :
- Surveillance de la grippe
- Sérologie de la rougeole et de la rubéole
- Surveillance du VIH